Die Backzeit für Käsekuchen ist entscheidend für das Gelingen des Kuchens. Sie beträgt in der Regel zwischen 60 und 90 Minuten, je nach Größe und Dicke des Kuchens. Wird der Kuchen zu kurz gebacken, ist er in der Mitte noch flüssig. Wird er zu lange gebacken, ist er trocken und bröselig.
Die optimale Backtemperatur für Käsekuchen liegt zwischen 160 und 180 Grad Celsius. Bei zu hoher Temperatur kann der Kuchen verbrennen, bei zu niedriger Temperatur wird er nicht richtig gar.